勃艮第的葡萄酒大多数采用单一葡萄品种酿制。主要的红葡萄品种是黑皮诺（Pinot Noir）。尽管在法国之外也有所种植，但是天性娇贵刁钻的黑皮诺却只在勃艮第的风土上才能展现独一无二的优雅风姿。主要的白葡萄品种为霞多丽 （Chardonnay），被在世界各地广泛种植的霞多丽也惟有在勃艮第才展现出特别的魅力，它不仅拥有丰满的口感，还保有少见的强劲与细腻变化，以及惊人的久存潜力。

除此之外，勃艮第地区还种植着一些其他葡萄品种，红葡萄佳美(Gamay)主要种植在勃艮第南部的马贡(Macon)地区, 主要用于和黑皮诺混合调配，酿造较便宜的勃艮第大区酒，勃艮第北部的欧塞瓦大区的伊朗西产地(Irancy)，种有一些希撒(Cesar)红葡萄，风格粗犷、艰涩。白葡萄品种最有代表性的是阿里高特(Aligote)，口味清淡，高酸爽口，除可以生产解渴的干白外，还非常适合酿造起泡酒，生产阿里高特最著名的产地是布哲隆(Bouzeron)。其余的白葡萄品种，如长相思，最出名的是夏布利大区的圣布里(Saint-bris)。此外，勃艮第还种有少量的白皮诺和灰皮诺，但并不单独以法定产区装瓶。